資訊工程學系,於 1995、1997、2000、2001 年依序成立碩士、學士、碩專及博士班,2008 年與花蓮教育大學資訊科學系與學習科技研究所合併,2011 年成立國際碩士班和學士班,同時招收本地與全球菁英人才,2022 年獲教育部同意成立「人工智慧與創新應用碩士班」。
現有 20 位專任教師,擁有國內外博士學歷及豐富產業經驗,分別投身於人工智慧與機器學習、雲端運算與大數據分析、多媒體、電腦網路與分散式系統、資料庫與知識庫系統、VLSI 與嵌入式系統設計、平行與分散式計算、行動與普及計算、軟體工程、密碼學與資訊安全、計算理論與演算法、人機互動系統、程式語言與編譯系統、生物資訊、最佳化與決策支援、學習科技等領域之教學與研究工作。
研究所與大學部學生合計超過 630 位,其中包含來自全球三十多國家的外籍與交換生超過 180 位,與本籍生共同學習,激盪出跨文化交流火花。本系以培育兼具尖端資訊知識技能與全球視野的一流人才,及提升東部產業為主要目標。發展重點著重於透過電腦資訊相關科技,促進跨領域科技整合,擴展資訊科技在各領域之應用。